唯识学不但要说明人生真理，还要解释整个宇宙物质世界的真相，而阿赖耶识的提出首先就是作为物质世界的本体。在《摄大乘论本所知依分》当中说： 此中最初且说所知依即阿赖耶识，世尊何处说阿赖耶识名阿赖耶识？谓薄伽梵于《阿毗达磨大乘经伽陀》中说：无始时来界，一切法等依；由此有诸趣，及涅槃证得。关于无始时来界的界历来有多种解释，世亲论师把界作为一切杂染有漏诸法种子，而真谛的译本里，把界译作解性，直白的说，就是认为界就是如来藏。在本论中界显然有本体的含义，并且这里的界是作为宇宙人生的生存所依而出现。

将《阿毗达磨大乘经伽陀》里的这段偈颂翻译，便是：无始时来，这界是一切事物的依靠，有了它才有生死流转的诸趣和清净还灭的涅槃证得。

而无著菩萨在这里真正目的是把界解释为阿赖耶识，从而为他的整个唯识体系确立一个坚实的基础。他要完成一个万法唯识的佛教宗派哲学体系，不仅要从逻辑上解释万事万物都是以阿赖耶识为根本识的诸识变现，而且作为宗教理论最重要的还是需要佛陀的印证。所以一开始他引经据典，就是要说明阿赖耶识是确实是世尊所说，确实是整个物质世界的本体。这里需要说明的是：大乘佛教是不承认客观物质世界的实有，它从认识论出发把一切存在当成认识对象，也即是法。 法包括精神存在和物质存在， 界是一切法所依，自然也是物质世界的本体。唯识学认为阿赖耶识是有漏世间的根本，我们所认知的世界都包含在阿赖耶识中，如无著在《显扬圣教论》中云：阿赖耶识亦是有情世间生起根本，能生诸根、根所依处，及转识等故。亦是器世间生起根本，能生器世间故。又即此识亦是一切有情互相生起根本，一切有情互为增上缘故。而《宗镜录》也说它变现根身世界，外而世界，内而身心，都是由此识中的种子变现出来，所谓万法唯识，就是指这个阿赖耶识。

很多人把阿赖耶识比喻成一个仓库，所有种子都被保藏在里面，当遇到外缘成熟并且触动的时候，种子就会现行，其实这就变相承认了这个阿赖耶识是宇宙的本体。